神探狄仁杰中的狄仁杰破获了不少案件，每个案件都是关系朝廷的惊天大案，比如幽州使团案挑起两国战火、蛇灵案利用洛水覆灭朝廷、邗沟覆船案掌控国之命脉等等一些，可是这些案件有一件大案非常的特殊，同是也让人感到别扭不已。
这个案件开始是狄仁杰帮助皇帝武则天清剿了蛇灵逆党，抓住蛇灵主使袁天罡破获了蛇灵案，但狄仁杰顾及皇帝武则天便辞别朝廷自行离开了，皇帝便让狄仁杰去江州休养一段时间。在江州没多久，江州发生了连环杀人案，而且死的都是当地的命官，狄仁杰没有多久被朝廷官复原职命其查查此案。
这个案件就是血色江州案，调查中狄仁杰发现这个案件中存在着不止两股势力，先是以平南侯府为一股势力，平南侯和他的几个大哥兄弟在二十年前是水匪为营生，曾在一艘客船上杀过一家人意外得到一封密信和一份身份文碟，于是当时的平南就化身为薛青麟，和他的大哥兄弟秘密地与梁王武三思会面。
可梁王三言两语就识破了他们的身份，但梁王被化身薛青麟的平南侯说服，梁王便让他今后一直要化身薛青麟，之后梁王便以这封密信栽害黄国公全族，皇帝武则天凭借密信中的内容将其满门抄斩，如今的平南侯和他的兄弟们有的高官厚禄就是踩着黄国公全族鲜血换来的。
可如今平南侯的身为朝廷命官的兄弟一个个死去，不免让他怀疑是黄国公的后人寻仇。过了不久，果然平南侯府被血洗干净，平南侯也被杀死府内的密室里。经过狄仁杰的缜密追查，发现内卫也是插手了此案，身为内卫当也是为皇帝武则天办事，想为皇帝在平南侯府查找二十年前的那封密信，但事情无法控制了便血洗了侯府，而策划者便是狄仁杰的学生温开，几年前的曾泰，如今的温开让狄仁杰也是感叹不已。
在平南侯临时之际，让他万万没想到整个连环杀人案的幕后元凶竟是五平县令林永忠，此人正是当年被他和他兄弟在客船杀了一家人，如今五平县令真正的薛青麟。薛青麟杀完了这最后一个仇人之后，还是没有逃过狄仁杰的火眼金睛。
大家不知道有没有发现，此案的幕后黑手与其他案件的元凶有这本质上的区别，那就是血色江州案的薛青麟并不是为了权和利引起腥风血雨，只是以一位背负全家血仇的受害者，向哪些为害一方的恶人报仇，此案死去都是恶人而薛青麟也是被狄仁杰保住继续当官，成为了神探狄仁杰里唯一一个得善终的大案策划者。
