当时朝政被东厂太监总管曹正淳所把持，曹正淳自恃掌管东厂，权倾朝野，结党营私，勾结贪官，无恶不作，因此与神侯誓不两立，时刻找机会铲除护龙山庄。神侯则矢志要“清君侧”，将他伏法以保社稷。
当时出云国派一男一女高手来中土献妃，其实背后另有阴谋，他们掳走太后，为难朝廷。而成是非也在因缘巧合之下，与皇帝御妹云罗郡主合谋，由他假扮太后，智退出云国高手。云罗郡主与成是非也因此事成为爱侣，可是，成是非出身低微，要娶郡主，无疑是癞虾蟆想食天鹅肉，受群臣反对。成是非愤而出走，惩贪官，杀污吏，云罗郡主亦为了忠于爱情而离宫找成是非，两人携手闯荡江湖，乐也融融。
段天涯在东瀛学武时，本与柳生但马守的女儿柳生雪姬相恋，却遭但马守大力反对，雪姬还为了救天涯而死于但马守刀下。段天涯为此在她坟前立誓终生不娶！而当段天涯去云国调查献妃一案时，与但马守狭路相逢，此刻仇人见面，但马守自然不会放过这个机会，追杀段天涯，段天涯却被柳生但马守的小女儿柳生飘絮以肌肤之亲的方式所救。然无独有偶柳生飘絮当年虽年幼对姐姐所拥有的都无不向往，偷偷的也非常欣赏姊姊的爱人。表面上飘絮三番四次不惜与父亲但马守反目，拯救段天涯的性命。在责任面前段天涯难免将也因为她是雪姬的妹妹而接纳了她。
很快便传来柳生飘絮有子的消息，于是天涯辞官于妻室双双隐居于蛇岛。途中一直对感情混沌不清的海棠终究明白了对天涯只是兄妹之情。黯然回京后却因搭救成是非的事情，无意间发现归海一刀对其早有爱意，于是感情再次混沌的上官海棠这次选择了逃避。
于此同时，在上官海棠被神侯怀疑之时，刀棠两人便暂时安身于一刀母亲带发修行的居所。在一刀一再的追查下，某日的夜里归海一刀发现了其父亲归海百炼成名的武功秘笈（雄霸天下）。练成此种魔刀之后，归海一刀更加迫切的希望能找到杀父仇人，用父亲的成名作来手仞真凶。只是窘于死无对证之时，神探张敬酒提供了一条有力的线索。
当年在辟邪山庄的店小二被找到了，虽然已经变成了疯子却一息记得那日夜里归海百炼最后见到的人的名字。通过去疯人山庄的经历，事后归海一刀一行了解那三人便是当年其父的拜把兄弟，麒麟子，剑惊风，了空和尚。但事有乞巧在海棠再三警告一刀未果的情况下，那三人却陆续自杀在归海一刀的面前，（麒麟子直接自杀。剑惊风在海棠一再袒护下虽一刀不再下手，却因一刀依旧苦苦守候在天下第一庄门口而促使其自杀。麒麟子与剑惊风的自杀已刹是蹊跷，归海一刀却仍旧执意要去了空那儿问个明白，怎知了空竟自愿挨了归海一刀的一刀死了，临终前还劝诫其不要再杀生了）。
事有唐突归海一刀百思不得其解，竟在一次无意间发现了杀父者乃自小将他抚养成人、爱他如命的娘亲。归海一刀如遭雷殛，他如何能报仇？再者，他即以练成“雄霸天下”刀法，自己也不慎如同归海百炼般走火入魔，甚至还学会了更为毒辣的招式阿鼻道三刀，魔性已不能遂心控制。在这种情况下为了压制魔性一刀常常躲进深山，也为了防止自己会不慎杀害自己的娘亲。
并且无独有偶，东厂方面也因政权党争借一刀的事情来栽赃护龙山庄。一时之间仿佛所有的证据都直接指向了消失已久的归海一刀。只是不巧的是在为了不再伤害海棠，归海一刀早已将其右臂砍下，并且在了凡大师的点化下决心彻底清除魔性。 将闭馆七七四十九天，海棠陪之。但因铁胆神侯被人迫害，上官海棠终究先行离去。
回到护龙山庄后，恐怖的血案并没有停止，甚至变本加厉，连国舅及文华阁大学士也被杀，深知归海一刀武功已失的海棠极力向皇帝表示这绝对是有人故意布局的阴谋，摆明是敌人有意嫁祸给一刀及护龙山庄。然原本笨笨傻傻的皇帝却刹是变得深不可测，告诫海棠这一切不像她所的那么简单，只涉及东厂的人。在申诉未果的情况下，海棠眼睁睁的看着神侯被关进了天牢。于是天玄黄决心劫狱，却见到神侯一副忠贞报国死不逃跑的样子，反而差点被东厂的人给炸死。经过这一番事件，神侯表面在曹正淳迫害下，自杀而死。正当东厂乘机发难得手，曹正淳正准备独揽大权，图谋造反之时，神侯竟奇迹般的复活并将其杀死，原来他是要借假死之局骗倒曹正淳好让他露出自己的真正目的，这样一来神侯就可以堂堂正正的将曹正淳一党全部除掉了。
曹正淳死后，护龙山庄更加昌盛了，于是铁胆神侯终于露出了他的真面目，原来他早就不服先皇传位给他的儿子，而不传位给他，故而卧薪尝胆二十多年，图谋篡位，而所有的人都只不过是他的一粒棋子罢了，不管是对他忠心耿耿的部下还是从小养大的义子义女！他唯一保留的真挚感情，便是他对素心矢志不渝的爱。可以说神侯为了素心可以不顾一切，可以说是天下第一痴心男人，最终也是这份深深的爱将他打败。
铁胆神侯最让人感动的一句话是他在以为素心真的死去时，对着在夜幕中的滂沱大雨，泪也滂沱地仰天大喊道：“老天爷，我愿意用十年、二十年、三十年来换素心一条命！”
