国民党建党100多年来，国民党内派系林立，宗派主义作风由来已久，从中央到地方都有大大小小的反蒋派系，他们在长期的政治、军事斗争中与蒋介石貌合神离，积怨或深或浅。蒋介石在1949年初下野时曾说：“我现在不是被共产党打倒的，是被国民党打倒的”。
国民党内的派系斗争可见一斑。新华社在1946年8月19日评蒋介石5大军事弱点时，就将“中央军和杂牌军的矛盾”、“首领意图和下级情绪的矛盾”列入其中。在蒋介石“打死敌军除外患，打死我军除内乱”的利用消耗方针下，这些反蒋派系在追随蒋介石进行反共内战的同时又不可避免地为保存实力而各自心怀异志。
蒋介石用人三大原则：一黄埔门生，二浙江籍同乡，三亲信嫡系。在此之列的有别，不在此之列的更是有天壤之别。解放战争中，蒋介石袒护嫡系、任人唯亲的做法变本加厉：嫡系将领骄横跋扈，即便位低也是权重，嫡系部队装备精良，常常无功受赏。
相反，非嫡系将领则处处受制于人、有职无权，他们的部队多被分割、缩编，有时连最基本的军需物资都得不到解决，却打仗在前、有功无赏，部队不仅受到特务监视，还要受其侮辱。就连毫无政治背景的，也要受到派系的排挤。傅作义、肖秉钧等很多起义将领在回忆起这种“排异己、灭杂牌”的政策时，无不义愤填膺，倍感绝望：“追溯过去为反动派作帮凶，搞得国事日非、民不聊生，到头来仍被他们猜忌歧视” 。
此外，将领之间，无论是嫡系还是非嫡系，无论是不同派系还是同一派系内部，经常为了权与利而结党营私、明争暗斗。1949年12月21口，于四川什郁起义的原国民党第16兵团是四川军阀孙震的老部队，率部起义的将领之一的董宋布时任国民党川鄂边区绥靖公署副主任，他与孙震不仅是同乡，还是从小学、中学到陆军学校的几次同学，以及几十年来一起工作、战斗的老同事，可谓是患难与共、祸福相依的莫逆之交。
但是二人却也曾因为权力之争而反目成仇，表面上互相尊重、虚与委蛇，实则彼此间的矛盾却在日益尖锐。孙震被任命为陆军第41军军长、第22集团军总司令、第5绥靖区司令官、
川鄂边区绥靖主任等职的时候，董宋布都被保为副职。孙震一方面想利用董在群众中的威信以笼络军心，利用董的才能为自己办事，另一方面又担心董谋权篡位，所以不敢委以重用，这样，董的名位虽高，却只是批阅公文，处理一般性事务而已。在孙震的压制下，董宋布“常有郁郁不得志之感”，“但也无可奈何”，
国民党部队之间协作很差，在战斗中只顾自己，见死不救的现象时有发生，由分配不公或其他矛盾引发的冲突迭起，以自己的战略位置定夺别人兵力布署的个人本位主义屡见不鲜。
不少统帅更是经常凭空下命令，以致部下在实际行动中无法完成任务。但凡失利，从不反观自身，部署轻则通令训斥、重则撤职查办。
据原国民党第1兵团第60军副官长张维鹏和原国民党第1兵团第60军转编第21师政治部主任张第东回忆：国民党第60军被派驻东北后，被东北保安司令长官杜幸明分割建制，其蓄意肢解第60军之叵测居心使全军上下大为不悦。
1947年，杜幸明在不明敌情的情况下令原本兵力单薄的第60军进犯临江，结果暂编第21师第2团抵杉松岗山岳地带时被设伏的解放军包围，团长魏玉权仅率残部逃回，车马瑙重和山炮损失殆尽。不料正当部队抱怨杜幸明轻举妄动之时，杜幸明却来电“严辞斥责暂编21师训练松弛，战志不高，并说‘该团长指挥无能，十不用命’，令将魏玉权撤职”。
直到现在，就是现在的国民党也是内部矛盾重重，被赶得四处躲藏，一天不如一天，你说安能不败？
