司马聃（公元343年——361年），晋康帝司马岳的长子，东晋王朝的第五任皇帝。司马聃幼年即位，太后听政。他是个比他老子司马岳还要无能的皇帝。
司马聃能当上皇帝，得益于他老子司马岳的背信弃义。晋康帝司马岳本来就是接替兄长司马衍的皇位，当时他曾将大哥司马衍的长子司马丕立为琅琊王，表示将来会传位于大哥的儿子。公元344年，司马岳病重，他在临终前三天下诏，立自己的长子司马聃为嗣。此时庾氏兄弟正在外面率兵讨伐石虎，无暇顾及政事。司马岳病死后，不到2岁的司马聃即位当了皇帝，即晋穆帝。
司马聃能坐稳这个皇帝的位置，得益于他的母亲褚太后。褚太后出身东晋名门望族。褚家世代都是当朝高官，她父亲褚裒更是一代名人。司马岳在当琅琊王时，就娶了褚氏为琅琊王妃。后来司马岳当了皇帝，褚氏就成为皇后。再后来，皇帝司马岳病死，褚皇后升级为褚太后，抱着2岁的皇帝儿子临朝听起了政。
褚太后为了儿子能坐稳这个皇位，首先就得对付当时专政的庾氏集团。她命何充为辅政大臣，任会稽王司马昱为抚军大将军，也参与大政。不久后带兵出征的庾冰、庾翼兄弟就相继病死了，褚太后趁机收回了庾氏集团把持的军权，彻底铲除了庾氏集团。同时，她又为东晋王朝树立桓温这么一个大敌。
桓温是东晋名将。当时为了与庾氏集团争兵权，褚太后在庾冰兄弟病死后，任命时为徐州刺史的桓温为安西将军，总领六州军事镇守长江上游军事重地。手握重兵后，桓温的野心也就暴露出来。
公元346年，桓温起兵讨伐西蜀的成汉政权，成汉国主李势战败投降。蜀国灭亡，桓温威名盛传，对朝廷构成威慑。会稽王司马昱为了和桓温抗衡，也发展了自己的势力，他任用了扬州刺史殷浩参与朝政，对抗桓温。
当时鲜卑族南征，朝廷怕桓温功高震主，故意不派他出征而派出了殷浩。然而殷浩终究是个文人，根本不会行军打仗。结果殷浩打了败战，粮草和武器也败光了。朝廷只好派桓温北伐，桓温出征后却势如破竹，一路打到洛阳。桓温的军事才能再次得到证明。
公元357年，司马聃已经15岁了，冠礼之后，他就正式亲政了，而褚太后则退居二线。不过此时的司马聃已经习惯了安逸奢靡的宫廷生活，根本不愿意操劳国家大事，朝政大权就一直把持在了桓温手中。
公元361年五月，长年沉溺于荒淫享乐的司马聃终于把自己的身体搞垮了，病死在建康皇宫的显阳殿，终年19岁。死后葬于永平陵，谥号“穆帝”。其在位17年，除了会在后宫与姬妾们淫乐享受外，在治理国家的问题上没有任何的作为。
