两方面原因。
第一，交通不便。
在古代很长一段时间，中原人都以为福建是个岛，原因就是古代福建人去中原，大多是搭船前往。中原人见得多了，就以为福建与中原是没有陆路相连的。
虽然后来中原人意识到福建是岛的概念是错误认识，但中原人同时也意识到，走陆路去到福建，相当之麻烦。
从春秋到秦初，北方政权的大军在福建的武夷山西侧多次发动试探性攻击，但总是找不到能走大部队的大道。
比如当时的楚国，势力范围都已经渗透进了云南，但对离自己统治核心区域距离更近的福建就是渗透不进去。
秦始皇统一中国后，凭借强大威的慑力，逼迫闽越和东越臣服，并且在福建地区设立了闽中郡。但秦朝对闽中郡的统治政策并不是像治理南越（两广）那样指派郡守、县令管理，而是实行羁縻之策，即委任当地土著首领管理，让他们各管各的地盘。
也就是说，福建在中国统一后，仍然是一个相对独立的王国——名为郡，实际仍是一方诸侯。
汉代后，尤其是中国经济重心南移后，中原王朝对福建的管理越来越加强，福建半独立王国地位渐渐消失，也变成了中央管理，但交通不便仍然是一个大问题。
当时除了走海路，福建陆路基本不通。即便打通了几条闽道，也是如蜀道一样，运输很是不方便，还不如走海路。
李白曾说“蜀道难，难于上青天”，他是没到过福建。他如果走过闽道，估计也会说“闽道难，难于上青天”。
新中国建立之前，福建除了昙花一现的漳厦铁路外，没有与外界相连的铁路，这在沿海省份中，是独一份。一直到1957年，建成通车了鹰厦铁路及随后的外福铁路后，福建才结束了不通铁路的历史。
其实我们看一下沿海各省通铁路（与外界相连的铁路）的时间，就可以发现福建进出不便的现象，自古以来就存在。
而交通不便，这让中原统治者对福建这块区域如何提的起兴趣？
第二，战略上不划算。
福建七山二水一田，平原地形很少，而且平坦地区都集中在沿海一线。也就是闽江入海口的福州-马尾地区；晋江入海口的泉州-晋江地区；九龙江入海口的厦门-漳州地区。
虽说福建有十分之一区域是耕地，但这些区域的缺点是都没有纵深，没有上游腹地。不可能形成珠三角，长三角那种大集散地。离开了沿海，福建内陆全部都是山区，路也是难走的转山路，经济带小。
古代海运不发达，而且重农轻商，福建的农耕潜力小，部分重农抑商的朝代自然是看不上眼。当然南宋、元朝重视商业，福建曾有一段时间很风光，被统治者看重。但到了明朝，又恢复重农抑商政策后，福建就又被统治者忽视了。
值得一提的是，其实不止福建，广东省的东北部，浙江省的南部，江西省的东南部，自古也都是不争之地。这些区域多山少田，不盛产粮食，也缺乏自然资源，中原王朝对这些区域的重视程度都不高。通常来说，中原统治者占领几块经济价值较高的区块后，就不会往深山腹地继续延伸势力了。这也是这些地区会形成客家人聚集区的原因。
（侵华日军当年也避开了这些区域）
也就是说，古代统治福建最理想的方式，就是控制住沿海的几块冲积平原即可，余下的内陆丘陵既无法左右战局，又缺乏能战略价值。把统治秩序交给当地族长管理即可，这属于有意忽略，符合情理。
另外福建自古民风彪悍，闽人平日和善，但逼急了还真惹不起。当年侵华日军想攻占闽北要地南平，但刚进入闽北山区就被当地老百姓自发组成的民兵第十师打蒙了圈。所以民风这方面，也是历代中原王朝不想在福建投入过多精力的原因之一。
