首先要说明的是，两晋系出一脉。由于西晋的速亡。所以来说，东晋与西晋的血缘关系很近。不向东西汉血缘那么远。东晋的开国皇帝叫司马睿，字景文。司马宣王司马懿嫡曾孙。琅邪恭王司马觐之子，晋武帝司马炎从子。可以说，如果没有八王之乱，贾南风乱政。无论如何也轮不上司马睿一脉当皇帝，
而在当时史载：司马睿有帝王之气。龙凤之资。唉。这牛皮吹的。这只能说明司马睿有运气。天大的运气。
公元304年，成都王司马颖裹挟大傻皇帝司马衷和琅琊王司马睿部分宗室逃到邺城。司马氏家族也许血液不干净。都快亡国了，司马颖还在大肆斩杀宗室，司马颖的行为让司马睿十分惊惧，怕哪天自己也被宰了。于是连夜冒雨逃出邺城。司马颖下令严守黄河渡口，必须活擒司马睿，侍从好不容易掩护司马睿渡过黄河。来到建业。此时晋怀帝已经登基，下旨让司马睿坐镇建业。司马睿初到江东，当时的江东基本上已经是门阀政治了，豪族，士族基本把持的上层社会。
东晋皇帝没有实际上的权力。这样就导致也就无法再次统一。江东世家豪族既有本土，也有北方南迁而来的，主要是临沂王家，太原王家，谯国桓氏。颖川陈氏，廋氏。这些家族基本把持东晋政权，直到东晋亡国。也就是说南朝直到隋朝统一也始终是门阀政治。由于江东聚集了大量的豪族，有了强大的经济和政治基础。为东晋的建立打下了良好的环境。
公元318年4月，晋愍帝被杀，在江东各个士族，豪强，以及逃到江东的西晋旧臣的拥戴下，41岁的司马睿正式登基为帝。就是晋元帝，改元太兴。江东王家为东晋的建立有着最大功勋，是东晋第一豪族，王马共天下不是虚言，而是实际情况。这里的王不是指王导一族。而是所有的江东门阀世家。东晋朝廷有新贵，也有旧臣，有强龙，就有地头蛇。新旧贵族争夺的就是政治与经济利益 。
司马睿对此一味的搞政治平衡只能解决一时，但无法从根本解决问题。再说一个没有实际权力的皇帝也用处也不大。新旧贵族包括与宗室之间斗争的很激烈。
东晋所有皇帝轮流做，但从来没有掌握实权。始终是傀儡皇帝。世家和军阀始终掌控东晋朝局。东晋立国103年。始于元帝司马睿，终于恭帝司马德文，共11帝。公元420年被刘裕篡位。司马氏皇族无善终，被刘裕杀绝。
